媒體報導，「美濃大峽谷」起因為深藍背景的前地方民代之子，引入屏東里港幫盜挖集團進入美濃，回填事業與建築廢棄物；另外，美濃某藍營背景的里長之子有意插手，爭利失敗後四處檢舉，指柯志恩恐是被利用的棋子。
柯志恩對此表示，之所以關注美濃大峽谷，是因接獲民眾陳情，當地農地被挖出深達20公尺坑洞，砂石車進出壓毀道路，導致民眾摔車受傷。7月28日豪雨期間，她與議員到場查看，發現情況嚴重，隨即安排會勘，才引發後續討論。
針對外界影射她與地方派系有牽連，柯志恩嚴正否認，強調正因自己毫無涉入才能勇於發聲，也因此獲得地方鄉親信任與陳情，她呼籲，與其散播不實情節攻擊她，不如正視農地長期遭破壞的事實。柯志恩強調，既然承諾推動修法、嚴查嚴辦，就會做到。
柯志恩反問，如果地方利益真如外界所說般盤根錯節，為何長期執政的民進黨沒有處理？她批評民進黨坐視不法業者破壞國土，顯示執政失能。她重申，支持市長陳其邁嚴查違法行為，並要求不法業者全數依法究責，呼籲外界勿再影射她與不法牽連。柯志恩最後表示，高雄服務處門口擺放著民眾致贈的蘭花，感謝她為美濃發聲，她把花放在最醒目的地方，就是提醒自己不忘民意託付，也歡迎市民到服務處泡茶聊天，共同欣賞這盆蘭花。
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