綜合日媒報導，這起擦撞意外中，海上保安廳飛機共載有6人，除39歲機長宮本元氣受到嚴重燒傷外，另5名隊員均罹難，分別為：41歲副機長田原信幸、27歲通信士石田貴紀、39歲搜索雷達士帶刀航、47機械士宇野誠人以及56歲機械員加藤重亮。

警視廳為釐清事故原因，事發後第一時間成立特別搜查本部進行詳細調查，並於日前進行司法解剖，報告於6日出爐，確認5人皆是因全身受到強烈的外部壓力衝擊擠壓而身亡。警視廳目前已和倖存機長及部分日航受傷乘客分別問話，未來將進行調查事故原因。

另外，倖存機長事發前一天曾操縱另一架飛機，往來羽田機場和日本最南端的沖之鳥周邊，執行針對中國海洋調查船在該海域的調查工作，總飛行時間約7個小時，事後並未有疲勞或身體不適的報告。海上保安廳強調，這樣的工作行程是合乎標準的。

至於五名罹難隊員，其中一名隊員石田貴紀，僅27歲年紀最輕，其家鄉位於栃木縣，高中畢業即加入海上保安廳工作，每當家人生日，他都會帶他們到東京近郊飯店慶祝，是相當孝順的孩子。朋友透露，石田貴紀去年才登記結婚，夫妻倆還在籌備婚禮，面對石田貴紀離世，周遭的人都相當哀傷。