前新竹市長林智堅論文被台大認定為抄襲，台大國發所碩士學位被撤銷，時任林智堅指導教授、現任國安局長的陳明通，力挺學生林智堅也被檢舉，目前台大學倫會正在調查中。

16日傳出陳明通已經向國發所請辭兼任教授一職，在國發所的師資介紹頁面也找不到陳明通相關資訊，根據《聯合報》報導，陳明通以「台海局勢嚴峻」，國安局長公務繁忙為由，向國發所請辭兼任職務。

但台大16日發表聲明反駁陳明通是「請辭」，台大表示，「有關於本校國家發展研究所陳明通兼任教授，自111學年度起不再應聘兼課，並非辭職。」