美國食品藥品監督管理局18日發出公告，內容指出，一批來自台灣的金針菇被驗出含有李斯特菌，這類菌種可能會導致幼兒、體弱者或老年人感到不適，包括會出現高燒、劇烈頭痛、僵硬等症狀，嚴重的話甚至會導致孕婦流產。美國已經全面下架。
出貨公司是彰化縣香菇合作社，但出現問題的金針菇是來自雲林西螺的尚旺農場。根據農委會調查，總共有926箱、200公克一入，都從尚旺農場出貨，除了其中2箱用來檢疫，剩下的924箱都外銷美國。但令人疑惑的是，既然出口前都已通過國內SGS檢驗，為何還會出現問題？
陳吉仲指出，目前初步推測是可能因為國際航運時程拉長，以往外銷至美國約18至20天可到，但現在因COVID-19疫情影響航班，約40至45天才到，延長運輸的時程，恐怕進而增加了運輸過程中的汙染風險，正全力調查「包裝至運送」的各個環節。
據了解，台灣的菇類栽培技術已相當成熟，金針菇栽培基質都經過高溫滅菌，且栽培流程以超音波震盪RO水進行加濕，因此在生產過程中不可能發生李斯特菌的汙染，只要確保業者在在包裝及儲運的階段，能符合食品衛生相關規定，就沒有汙染疑慮。
此外，金針菇業者王璿斌也表示，「正常金針菇大概保存期限約1個月左右，現在塞港，造成我們這一批航運是1月份出口的、現在3月才到美國，中間已經接近60多天，已超出我們正常應該可以存放的時間。」農委會和業者都懷疑，可能是疫情影響船運時間，導致金針菇出現變化。
若民眾食用金針菇有疑慮，陳吉仲建議，菇類多以熟食為主，只要正常方式煮食、充分加熱烹調，就不必擔心細菌影響健康，可放心食用。
