部分罷免團體日前指出，連署書符合格式，卻因簽名潦草被剔除。南投縣選委會於5月27日回應，連署書查對係依規定辦理，若簽名潦草、簡寫或與「戶政資料」差異過大無法辨識，依法列為不合格，並將查對結果送交中選會審核，結果引起更大爭議。

中選會於5月28日啟動調查，針對部分名冊逐筆比對，並與南投戶政機關確認程序。中選會今（2日）發布新聞稿說明，戶政資訊系統未建置簽名樣式資料庫，戶政人員無從查對筆跡，且選委會人員並無系統查閱權限，相關程序是否違法，將由目前偵辦中的司法單位釐清。

中選會指出，馬文君罷免案原報2萬709份連署書，經刪除3,817人後，剩下1萬6,892人，距法定門檻仍差1,730人；經複查後，有199人連署資料修正為合格，總計合格連署為1萬7,091人，尚差1,531人。游顥罷免案部分，原報2萬3,160份連署書，初步剔除4,020人後剩下1萬9,140人，與門檻差距693人；經複查，508人修正為合格，連署總數達1萬9,648人，尚差185人。

中選會強調，目前南投地檢署已就罷免案相關疑義分案調查，選委會與戶政機關皆會全力配合司法偵辦。馬文君、游顥案的連署補提期限維持不變，分別為6月3日與6月5日。