據了解，建臺高中原本欲報考歷史的文組學生，被誤報為考生物；原要考生物的理組學生，則被報成考歷史。學生準備3年，卻在考前2天才知情，消息引發社會關注。
對此，教育部主任祕書林伯樵說明，分科測驗報名時間為6月5日至17日，學生是由學校集體報名，系統設有多重確認機制。報名完成後，學生可自行上網確認，學校也會收到大考中心回傳的確認表，學生需簽名確認報考資料。林伯樵坦言，這次在多個確認點都未發現錯誤，「都有責任」，教育部也感到遺憾。
林伯樵指出，教育部於7月8日才接獲通報，但試務相關資料已於7月9日出闈，包含試卷、座位表與考生名冊都陸續送往全台各考場。全台考生近3萬9,190人，任何臨時變動都會對考試公平造成重大影響，因此決定不開放更動考科。
目前教育部已責成國教署進一步調查報名流程及錯誤發生原因，釐清建臺高中是否有疏失與責任，後續將視調查結果採取適當處置。
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