台鐵局長杜微16日視察「東部地區軌道工程安全查核」，也與相關單位一同到鳴日號發生異常的區段查看，再到鳳林站值班站長室，詳細了解工程電報派發、傳達、施工申請/解除、台鐵與鐵道局的協調聯繫、工項、工法、完工檢查、應變程序、通報及作業，並針對施工安全召開檢討會議。
杜微對此表示，目前交通局已啟動行政調查、國家運輸安全調查委員會（運安會）也立案調查，台鐵將全力配合，在釐清真正原因前也要完成內部檢討，使未來各項工程作業能正確無誤，設施、設備都要維持在最安全的狀態下營運。
依照施工相關規定，施工單位向台鐵局申請核准後，會派人通知台鐵工務段雙方於施工完成後進行完工檢查。
至於當日為何會發生列車跳動，鐵道局表示，原先的雙軌工程因故延後，11日當天進行軌枕抽換工程，相關人員認為軌枕抽換僅剩下短短9公尺左右，不需要請台鐵用砸道車，改用人工砸道方式；現場施工人員也有待到第一班列車通過後，確認沒有問題才離開現場，但砸道仍然沒有很確實，已經要求檢討改進。
