外交部發言人歐江安22日表示，由於菲律賓入境檢疫規定經常依據當地疫情隨時調整，也曾發生菲國機場檢疫局（BOQ）官員未能正確解讀相關規定，導致曾有國人持我國衛生福利部核發的「國際預防接種證明書」（簡稱「黃皮書」）入境時受阻。

歐江安指出，我國駐菲律賓代表處已經向菲國政府嚴正交涉與說明，我國衛福部是依據「國際衛生條例」（IHR）相關規定核發黃皮書，並且已經獲得國際社會普遍接受，因此促請菲方儘速修訂入境相關檢疫規範。

菲律賓政府答覆，目前已在規劃採認台灣數位疫苗證明，並提出希望台灣跟菲律賓可以相互承認對方所核發的數位疫苗證明。菲方認為，這樣可以有效避免機場第一線人員，來不及解讀防疫規定的狀況。對此，外交部已將菲方要求提報呈請中央流行疫情指揮中心參考辦理，待指揮中心專家小組討論決議。

歐江安表示，在兩國尚未互相承認疫苗證明之前，我國完整接種疫苗者若要入境菲律賓，還是必須出示登機前48小時的PCR陰性證明，並事先訂妥6天5夜的防疫旅館，外交部領事事務局網站相關資訊也已更新，建議近期有意前往菲律賓的國人，可事先查閱外交部領事事務局網站，以獲得最新的資訊。

外交部也提醒，全球各國針對其疫情發展與防疫需要，都採行程度不一的邊境管制措施，並進行滾動式調整。外交部將持續密切注意菲國入境與隔離檢疫相關資訊，並隨時更新提供各界參考。

對此，陳時中表示，菲律賓並沒有不承認台灣疫苗接種證明，可能只是行政程序上無法太完整，導致時間或個人上的落差，不過就案件目前發展而言，非常願意跟菲律賓站在互惠的角度，互相承認數位疫苗證明。