卓榮泰今出席活動受訪時，澄清昨雖是私人行程，但國內的狀況還是透過行政院內部，完全了解、掌握到目前情勢的發展，並強調昨為假日、休息日，指此行是自費且私人的活動，唯一的安排就是跟國人一起為Team Taiwan加油，「沒有其他任何目的」，謝謝大家關心。
不過邱鎮軍稍早在臉書發文提出質疑，當全國百姓還在為盯著超市漲價標籤猶豫，或為省幾塊機票錢在半夜搶廉航特價時，卓榮泰親自示範什麼叫做「格局」，直呼「這場說走就走的『東京快閃』，簡直是私人行程的天花板！」痛批行政團隊在立法院對著國家預算錙銖必較、大聲喊窮時，院長在東京巨蛋的應援卻顯得如此從容。
邱鎮軍更進一步指出，院長輕便地踏進空軍松指部的專機停機坪，這不只是效率，更像是一種讓私人假日也能享有國軍級隱私與禮遇的體貼，認為行政院將此定調為「私人行程」，卻由軍事管制區起降，行政中立與公器私用之間的法律界線，也開始顯得有些模糊。
邱鎮軍更質疑，卓榮泰這趟行程其實處處都很精妙，「最令人嘆為觀止的，還是名義的自由切換」，綠委先稱這是「54年來首位閣揆訪日」的外交突破，被問到包機費用與資源使用時，行政院又迅速表示，這只是「私人行程」，揶揄名義玩得像魔術，批評「為什麼私人行程可以從松指部起飛？過程中是否動用了任何政府資源或維安人力？」認為卓榮泰院長應清楚向社會大眾交代。
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