調查局台南市調處接獲情資，鄭亦麟擔任經濟部「綠能科技產業推動中心」副執行長期間，涉嫌收受太陽能系統大廠泓德能源（6873）、東煒建設2家業者賄賂，且個人與親友名下不明財產，因此報請台北地檢署由檢肅黑金專組檢察官高文政組成專案小組偵辦。
對此，鄭亦麟今（26日）凌晨由調查官戒護下前往北檢複訊時被問到相關問題，低著頭不發一語，並一直躲在調查官的後面。據了解，檢察官漏夜偵訊9名被告，目前除了鄭亦麟的雙親鄭伍廷、李佳珍以涉犯《貪污治罪條例》各諭知10萬元交保，其餘人則仍在偵訊中。
經過漏夜偵訊，稍早鄭亦麟的父母分別以10萬元交保候傳，其餘人仍在偵訊中。
事實上，現年34歲的鄭亦麟2014年自台大經濟系畢業，是前行政院長林全的學生，曾在民進黨智庫工作，並隨著林全擔任小英政府的閣揆後，一同進入行政院，並擔任能源及減碳辦公室主任。2018年（27歲）在經濟部與科技部合作設立的「綠推中心」任副執行長，成為台灣離岸風電區塊開發政策重要推手。
鄭亦麟2019年因熟悉風電事務，出任台船子公司「台船環海」董事，但消息曝光，引發譁然。而今年（2025）初，經濟部主導成立的綠電售電平台「台灣智慧電能公司」，延攬鄭亦麟為首任總經理，再次引起爭議與質疑。
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