聯席會議在8、9日進行兩天審查，朝野立委共提出237案預算提案，經過歷時近3小時的討論，多數提案已處理完畢，部分未達共識的提案將保留送交黨團協商。聯席會議主席、財政委員會輪值召委李坤城表示，初審完成後，特別預算案最快可在14日程序委員會排入17日立法院會議程，屆時有望完成三讀程序。
若17日三讀通過，行政院將請總統盡速公告，公告後生效，普發現金將於生效後1個月內開始發放，也就是預計11月中下旬即可啟動。行政院長卓榮泰及財政部長莊翠雲皆表示，政府將確保發放作業在7個月內完成，並於總統公告當天召開記者會，說明領取方式及時程。
此次韌性特別預算案總額上限為新台幣5,700億元，行政院於9月11日通過的版本歲出編列5,500億元，其中包含普發現金2,360億元，另保留200億元作後續產業支持用途。所需財源由以前年度歲計賸餘4,444億元及舉借債務1,056億元支應，114至116年度分別編列2,795億、1,242億及1,463億元。
不過，國民黨立委馬文君對國防部主管預算提出49項刪減案及2案主決議，認為部分項目不應納入特別預算，且與明年度總預算重複編列，例包括長效飲用水近8億元、聯合作戰中心長官座椅每張5萬元等開支。由於朝野未達共識，這些提案全數保留送交協商。
此外，教育部、勞動部及海委會等相關預算亦有意見分歧，同樣需送交協商，但不影響特別預算初審結果。
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