郭智輝上週五（22日）以公開信宣布，因健康因素請辭部長，並由行政院秘書長龔明鑫接任。據悉，他於8月初健檢時意外發現肝臟附近部分出現異常，醫師評估疑有癌變徵兆，21日晚間向總統賴清德報告病情，表明必須辭職接受治療。25日，他再赴台大醫院核醫部，接受正子斷層造影（PET）檢查，正由醫師評估後續療程。

在公開信中，郭智輝表示，部長一職需要「120分的投入」，但健康提醒他必須把責任交給下一位能全力以赴的人，這樣才是對國家與團隊最負責任的做法。

儘管身體狀況不佳，郭智輝仍關注綠能產業弊案。對於前綠能中心副執行長鄭亦麟涉貪遭搜索約談，他直言「有些人就是不自愛」，並強調「真正大尾的還未浮出水面」，呼籲檢方徹查到底、除惡務盡。