除了染紅，陳同孝還有不少爭議。之前他就被控強升九職等女祕書擔任十職等專門委員；讓僅有碩士學歷、專業也不是外語的教師，擔任進修學院的外語科主任，遭監察院關切；幫友好的教師申請永久免評鑑、護航升等；推薦性侵女職員的教師，擔任行政院公共工程委員會的採購評選委員，被教育部得知後撤銷提名。但台中科大均否認，強調校長在人事及行政上均合法合規。
鏡週刊2026.03.25 05:40 臺北時間
校長染紅騙兩岸3／強升祕書、護航徇私爭議多 陳同孝遭控染紅違學倫回應了
- 記者｜鏡週刊
本刊調查，國立大學遴選校長時，就曾因候選人「染紅」發生類似爭議！之前台科大校長候選人、台大化工系教授李篤中，就遭控違法赴中國兼職、拿中國經費做研究，後來李雖退選，但本刊追查發現，李疑似未向教育部報備，連續11年主持至少4個中國國家自然科學基金委員會補助的研究計畫，總金額超過新台幣千萬元，涉嫌違反現行《兩岸人民關係條例》。
教育部接獲檢舉之後，啟動調查，結果發現2009年起，李篤中以中國哈爾濱工業大學名義，申請中國國家自然科學基金委員會3項研究計畫補助，皆未獲主管機關許可，經查證屬實，最後是依《兩岸人民關係條例》規定，處新台幣30萬元罰鍰。
教育部指出，兩岸學術交流僅限於短期客座講學，中方不得聘任我方人員擔任教職或研究職務，且應依《兩岸人民關係條例》《教育人員任用條例》等法規辦理，參與中國各項國家基金及國家重點研發工作、現職公私立專任教師赴中國任教、為中國教育機構在台辦理招生或居間介紹，均明文禁止。台中科大校長陳同孝明顯踩到法律紅線，教育部有必要徹查到底，維護學術尊嚴。
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