樺加沙颱風造成花蓮光復鄉嚴重災情，考量災時強風暴雨造成嚴重積淹水，可能造成生態環境損害及飲用水受汙染，加上災後污水、污泥或災害廢棄物尚未清除完成，災區仍有短暫陣雨發生，可能增加類鼻疽、鉤端螺旋體病及腸胃炎等傳染病發生風險，疾管署提醒當地民眾及投入重建人員和志工，清理環境時落實「防疫三保」，避免傳染病威脅。

第一保：「裝備保護」清理時切勿赤手赤腳、穿拖鞋，以及直接接觸污水、污泥或災害廢棄物，務必穿著雨鞋或防水長靴、配戴防水手套及口罩，避免被生鏽器物（如鐵釘、鐵片等刺傷或割傷，以防感染鉤端螺旋體病、類鼻疽、破傷風等傳染病。如出現發燒、頭痛、肌肉痛、腹痛、腹瀉、黃疸、倦怠等症狀，請儘速就醫。

第二保：「飲食保護」水災地區蓄水池如遭污水侵入，應確實清洗、消毒後再蓄水；食物飲水要煮熟煮沸，食物保存過久或變質(泡過水或解凍過久等)請勿再食用。

第三保：「清潔保護」戶外區域可用市售含氯漂白水稀釋50倍（200cc加10公升水）噴灑庭院、水溝等潮濕處；居家環境可用市售含氯漂白水稀釋100倍（100cc加10公升水）擦拭或刷洗地板、牆壁、廁所等處；廚具及餐具應煮沸消毒或用10公升清水加40毫升漂白水浸泡30分鐘稀釋進行消毒，並以清水沖洗乾淨後再使用。同時應注意手部清潔，依「濕、搓、沖、捧、擦」五步驟正確洗手；如暫時無法取得清水，且手部無明顯髒污，可改用酒精含量75%的乾洗手液清潔雙手。

疾管署提醒，花蓮縣衛生局備有漂白水放置在醫療站，發放給前來索取的民眾，並將安排請當地志工和村里長協助逐戶發放，呼籲民眾在救災的同時也保護好自身安全。