職籃工會指控籃協未支付2018、2019、2023年瓊斯盃期間選手出賽費，並侵犯選手肖像權，工會表示，儘管曾多次嘗試與籃協及運動部溝通，但直至9月8日，問題仍未得到妥善解決，因此已協助選手提出民事求償。

對此，籃協發2點聲明回應，首先，針對2018、2019、2023年球員瓊斯盃出賽費，協會與工會歷經數次協商，雙方皆了解過去的出賽費甚難計算，牽涉出賽費如何計算、過去協會循往例發獎金是否納入計算、法規規定有盈餘時發放，那麼虧損年度是否不發放等等問題，協會表示，曾邀請工會代表參加2025年6月29日協會理事會，與理監事討論本案，但工會代表因故未出席。

此外，對於2024年瓊斯盃球員海報侵犯球員肖像權一事，籃協表示，販售海報非協會授意、主導，承辦賽事單位未得協會同意販售海報，協會知悉後，立即要求承辦單位下架海報，協會雖事前不知情，但作為瓊斯盃主辦單位，責無旁貸。與工會討論的過程中，承辦單位坦承未得協會同意販售海報，總營收為新台幣四千餘元，承辦單位願全數捐出、致歉，未得工會同意。三方當時未協調出解決方案。

籃協強調，在上述處理過程中，不論出賽費或肖像權侵權事宜，無球員直接或間接出面，協會無從得知球員真意。針對雙方民事求償案，運動部也作出回應，表示尊重工會決定，並已請籃球協會於一個月內盡速召集會議與工會討論、妥適處理，以維護選手權益。