環境部指出，台中市的處置方式嚴重違反信賴保護原則，也衝擊《空氣污染防制法》下的許可制度運作秩序。基於作為地方空污防制業務監督機關的責任，當時環保署於2020年2月依法行使職權，果斷撤銷台中市環保局對台電的裁處決定，目的在於維護全國空污防制政策的一致性、合法性與法規安定性。

環境部強調，減煤是社會各界的共同期待，中央亦支持透過公私合作推動節能減碳，但政策推動應遵循法定程序。若地方政府以處罰手段，強迫業者在無法配合的情況下達成目標，不僅缺乏法律依據，也不利於政策持續推動。

環境部補充，本案行政訴訟尚未定讞，其所做的撤銷處分目前仍具法律效力。空氣污染防制為國家重大政策，中央與地方依法權責劃分明確，為避免「一法多制」所造成的執法混亂，環境部將於收到判決書後依法上訴，並靜待終審法院的公正裁決。