檢方指出，明良臻涉嫌指示13位戶政事務所主任，針對罷免案提議人名冊中的簽名進行實地查訪，並要求透過戶政系統調閱個人簽章比對資料。當場有多位主任表達異議，明良臻仍堅持執行，副處長吳俊毅更提供透過戶政系統查詢電子及紙本簽名比對的建議。

檢方調查發現，這項行動雖以「協助選委會」為由，實則已超出職權範圍，涉有違法蒐集個資之虞。更甚者，明良臻在事發後還企圖刪除手機通訊紀錄，意圖湮滅證據，並將責任推卸給下屬，態度消極且毫無悔意，因此建請法院從重量刑。

針對爭議，花蓮縣政府行研處長陳建村表示，相信3位同仁無侵害人民權益或洩漏個資之不法意圖，強調縣府所有作為皆依法行政，呼籲外界勿過度政治解讀。然而，一級主管涉案、公器疑遭私用，仍引發外界高度關注。