菲律賓總統小馬可仕（Bongbong Marcos）15日在X上發文表示，「我代表菲律賓人民祝賀賴清德當選台灣下屆總統，期盼在未來幾年密切合作，強化共同利益，促進和平，確保人民繁榮昌盛」，因為這是菲律賓首次使用「台灣總統」一詞，受到關注。

不過菲律賓外交部16日表示，菲律賓和台灣有共同利益，包括身在台灣的近20萬移工，小馬可仕總統會祝賀台灣新總統，是因為小馬可仕感謝台灣接納菲律賓的移工，並成功舉行民主進程，聲明最後也強調，「菲律賓重申奉行一個中國原則」。

其實菲律賓外交部發言人達沙（Ma. Teresita Daza）14日就已經發表聲明，重申菲律賓致力奉行一中原則，馬尼拉和北京同意以和平方式解決所有爭端，「不訴諸武力或以武力威脅」，而在一中原則下，菲律賓承認中華人民共和國政府為唯一中國政府。