事發在日本時間今天（25日）下午4時15分，JR新宿站人員向警方通報，電車上有男子持刀揮舞，列車駛入站內一打開車門，車廂上的乘客一湧而出，現場一片混亂，事後車廂地板上雜物四散。

據《NHK》報導指出，持刀男子疑似是外國籍，被警方逮捕後供稱自己是名廚師，工作結束後把刀子包在毛巾內，準備搭電車回家途中，在車上小睡一下，結果毛巾意外抖落、刀子露出，被車上乘客發現。後續詳細情形仍有待日警調查。

而在列車抵達新宿站前，有乘客按下緊急按鈕通報，到站後大批乘客緊急逃往月台，在疏散旅客過程中，有3人不慎摔傷，分別為2男1女、約為20多歲和50多歲，當中有人送醫確認傷勢，全線也為此停駛約20分鐘左右，雖然已恢復雙向通車，但後續仍有多輛列車誤點。